Esta unidad recibe todo aquel paciente derivado desde el médico Oncólogo, el cual indica tipo, dosis y frecuencia del tratamiento a seguir. La prescripción indicada es recepcionada por la unidad quien la deriva a una Central de Mezclas para su preparación, la cual es entregada a la unidad de quimioterapia para que sea aplicada en el paciente.,

La Unidad de Quimioterapia cuenta con profesionales médicos, enfermeras, técnicos en enfermería y personal administrativo. Cuenta con 10 camas para hospitalizados, ubicadas en el hospital de Antofagasta, y 10 sillones para quimioterapia ambulatoria, ubicados en el centro oncológico. Realizando un total aproximado de 1500 atenciones al año.